PCR技术的问世使病原体检测能够快速、方便地进行。由于PCR技术假阳性率太高，只要有微量病原体存在就可得到阳性结果，这并不能作为诊断依据，只有当一定数量的病原体存在时才有临床意义。因此，对模板准确定量显得特别重要，应用荧光技术PCR就能够快速、准确地得到结果。对于解决学检测的“窗口期”问题，判断疾病是否处于隐性或亚临床状态，以及检测不能判定是现症还是既往时，均可利用PCR进行确定。
示例：新型冠状病毒核酸检测。
方法学：荧光PCR法。
用途：用于体外定性检测新型冠状病毒的疑似病例、疑似聚集例患者、其他需要进行新型冠状病毒诊断或鉴别。
检测基因：新型冠状病毒（2019-nCoV）ORFlab和N基因、E基因。
标本类型：上呼吸道标本：咽拭子、鼻拭子；下呼吸道标本：呼吸道抽取物、肺泡灌洗液样本、肺组织活检标本。
检测流程：
（1）核酸检测前的生物安全防护（工作人员个人三级防护的穿戴）→（2）样本的灭活（56℃灭活30分钟）→（3）样本的核酸提取（手工、核酸提取仪）→（4）PCR体系的配制和模板加样→（5）上机检测及结果分析→（6）检测后的消毒。
其他病原体检测：HIV、甲乙丙肝、HPV、肺支、肺衣、EB病毒、腺病毒、胞病毒、甲乙流、埃博拉病毒、B族链球菌。
适合开展的医院和：儿童医院、妇幼、儿检所、第三方、各种级别的有需求的医院。
辅料的质检通常是在新一批的辅料到实验室后统一做一次或者定期（半年或1年）做，因此质检就包含了验货和质检2个部分。由于辅料的质检没有一个统一的标准，一般由各实验室自行制定，可简可繁，这里提出一些方法供大家参考和批评指正。
1.外包装检查：外包装应完整无损无污，标识清楚，检查品名、品牌，货号，规格、生产日期，有效期、保存条件等信息。
2.内包装检查：内包装物品应与外包装标识一致，检查是否有破损，泄漏，内容物是否齐全，是否有相应的使用说明书等。
3.性能质检：检测试剂耗材是否与其性能一致，比如吸头的准确性和气密性等
4.污染物质检：检测试剂耗材是否被常规检测项目的待检物污染，这种污染可能是物品生产环节，也可能是运输或实验室的保存过程中被污染。
5.抑制物质检：检测试剂耗材中是否存在PCR反应的抑制物，比如核酸酶。
1.实验室空调通风系统设计及压力控制
PCR实验室并没有严格的净化要求，但是为避免各个实验区域间交叉污染的可能性，宜采用全送全排的气流组织形式。同时，要严格控制送、排风的比例以保证各实验区的压力要求。
2.污染的预防与控制
PCR实验室设计的问题是如何避免污染。在实际工作中，常见的有以下几种污染类型：扩增产物的污染；天然基因组DNA的污染；试剂的污染以及标本间的污染。由于一旦发生污染，实验就必须停止，直到找到污染源为止，而且实验结果必须作废，需重新进行实验。所以发生污染后再围绕实验室来寻找污染源不但耗时而且繁琐，浪费人力物力。因此要避免污染，首先应是预防，而不是排除。
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